HumanCoop Sáhara desarrolla su actividad en los Territorios Liberados del Sáhara Occidental, que comprende el área del Sáhara Occidental que se encuentra al este del muro fronterizo marroquí y al oeste y al norte de las fronteras con Argelia y Mauritania, respectivamente. Territorios liberados se encuentra separado del resto del territorio del Sáhara Occidental por un muro de 2200 kilómetros. Los principales asentamientos son: Agüenit, Bir Lehlu, Bir Tiguisit, Dougaj, Mehaires, Miyek, Tifariti y Zug. La población de los Territorios Liberados se estima en unos 30.000 habitantes.

Con una frecuencia trimestral, parten desde España grupos multidisciplinares de profesionales sanitarios y no sanitarios, para dar asistencia clínica a la población, formación al personal sanitario local y recopilación de datos con el fin de realizar estudios epidemiológicos en los Territorios Liberados. Desde el punto de vista sanitario, las comisiones incluyen las siguientes áreas de trabajo: Odontología, Atención Primaria, Pediatría, Ginecología y Obstetricia, Oftalmología y Laboratorio.

En las comisiones se realiza formación de los sanitarios locales y se deja stock de material para que puedan seguir desarrollando su trabajo, consiguiendo autonomía y empoderamiento de la población local.

En estas comisiones, las zonas específicas de actuación son: Bir-lehlu, Tifariti, Mehaires, Mijek y Agüenit. Allí la asistencia local es escasa, apenas una sola comisión médica anual llevada a cabo por el Ministerio de Sanidad Saharaui, y se encuentran fuera de los objetivos de la cooperación internacional.

Las comisiones cuentan con el apoyo del Ministerio de Salud Saharaui, lo cual proporciona viabilidad a los proyectos realizados allí.